The Witness est un jeu de puzzle en 3D où vous explorez une île mystérieuse pleine de structures naturelles et artificielles. Le jeu est axé sur la communication non verbale, ce qui devrait rendre le joueur plus attentif à l'environnement qui l'entoure. Pour terminer le jeu, vous devez résoudre des énigmes dans chacune des onze régions de l'île et atteindre la montagne située au centre. Bien que les régions diffèrent légèrement, les énigmes qu'elles proposent sont assez similaires et, en règle générale, ont un rapport avec la symétrie pour être résolues. Les énigmes s'activent sur les grilles que vous pouvez trouver autour des lieux. Il y a deux modes dans le jeu. En mode marche, vous pouvez explorer l'île, et en mode dessin de chemin, vous ne bougez pas et vous concentrez sur la résolution des énigmes. Bien que l'intrigue du jeu soit assez floue et que The Witness ne donne pas beaucoup de détails sur le passé du héros, sa caractéristique clé est l'aspect visuel combiné à la musique, aux citations inspirantes que vous pouvez entendre et au ton méditatif du jeu en général. Le jeu présente plusieurs illusions visuelles basées sur la perception de la profondeur.