Operation: Matriarchy

Au 24ème siècle, l'humanité s'est organisée en Fédération de la Terre et a colonisé plusieurs autres planètes. Cependant, vers 2350, un mystérieux virus ravage la planète colonie de Velia, ne ciblant que les femelles de la population. Elles se transforment en machines à tuer brutales, tandis que les mâles sont réduits en esclavage pour servir de nourriture ou comme sujets pour des expériences génétiques. Ayant évolué en une conscience collective agressive, les Véliens se retournent contre la Fédération, déclenchant une guerre brutale. Le jeu commence sept ans après le début du conflit, lorsque le personnage du joueur, le Sergent-chef Paul Armstrong de la Fédération, se retrouve contraint d'affronter les Véliens lorsqu'ils attaquent son vaisseau.